FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.2t08 September 30, 1999
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
/net/nfs0/vol1/production/webadmin/tmp/34279426069: 461 aa
>gi|120589|sp|P10901|FUCO_DICDI ALPHA-L-FUCOSIDASE PRECURSOR (ALPHA-L-FUCOSIDE FUCOHYDROLASE), 461 bases, AE0E8EC8 chec
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106472215 residues in 337126 sequences
statistics extrapolated from 50000 to 336929 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6323+/-0.000533; mu= 6.4624+/- 0.030;
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Kolmogorov-Smirnov statistic: 0.0345 (N=29) at 52
FASTA (3.28 September 1999) function [optimized, +1/-3 matrix (15:-5)] ktup: 2
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>>SWALL:FUCO_DICDI P10901 ALPHA-L-FUCOSIDASE PRECURSOR ( (461 aa)
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SWALL: KGVEVSLPIESTKPGITLNIPMVAPQDYPPYVYVFRLTDVE
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>>SWALL:FUCO_HUMAN P04066 TISSUE ALPHA-L-FUCOSIDASE PREC (461 aa)
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.....:. .. ..: .: : : ...:::::.:.:..:::.:::.:
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::.... .::::::::.:::::.: : : :::::: ..:: :.:::: .... ....
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::::::.:::.:::: : ..: . :: .:. : .: :.:..:.:.:::.::.: .
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.::.::.::::::..: ::: :.::::::..: ..::.:. :.:.: .: .:::: :.
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.:.:::::.:.::.:.::::: . : ..:::.. . :::. .. :..::: : .::
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.. :. :.::..:. .. . : :. ...:.. :. : ......:: :.
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>>SWALL:FUCO_RAT P17164 TISSUE ALPHA-L-FUCOSIDASE PRECUR (462 aa)
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10 20 30 40
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..: : : ...::::: :.:..:::.:.:.
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:.:::::... ::.:: .. .:. : :. .... .:.: ::. .: :.: .
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:::.... .::::::::.:::::.: : : :::::: ..:: :.:::: .:.. ...
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.::::::::::.:::: : ..: . :: .:. : .: :.:. :.:.:::.::.:
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..::.:::::.:::..: ::: :.::::::..: ..::.:. :.. :..: .:::: :
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... :.:: . . . . .:.: .:: :.. :::.::..::. .:.: . .:::
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.:.::.::.:.::.:.::::: : : .::::. .. ::: .. :.:::. :..:
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.. :. :.::..:: . :.: :. ...:.. : .: .....:: :.
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>>SWALL:FUCO_CANFA P48300 TISSUE ALPHA-L-FUCOSIDASE PREC (465 aa)
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10 20 30 40
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.....:: :... ..: : :....::::: :.: .:::.
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:.:.: ..:::... ::.:: :. . ... ... .:.: :: .: :.
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: . ::.... .::.:::::.:::::.: : : :::::: ..:: :.:::: .....
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....::::::.:::.:::: : .. : :: .: : .: :.:. :::.:::.::.
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: ..::.:::::::::..: ::: :.::::::..: ..::.:. :...: .: . :
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:: :..: :.:: . .: . :.: .:: ::. :::.::..:: .: : .
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.::: ::.:::::.:.::.:.::::: . : ..:::. . :::. .. :..::: :
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gi|120 SDPIGNNKTEATLLGLKGEKGVEVSLPIESTKP-GITLNIPMVAPQDYP-PYVYVFRLTD
..:. .. :. :.::.. : .. : :.: :. . .:... : . ....::
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460
gi|120 VE
::
SWALL: VE
>>SWALL:CAB53746 Cab53746 DJ20N2.5 (NOVEL PROTEIN SIMILA (467 aa)
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10 20 30 40
gi|120 MKMIIIFFILLILNLIKSQQYGPTWDQINSRPLPGWYDDVKFGIFIHFG
.. :::.....: ::.:.:..:::::::.:
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gi|120 IYSVPAFANGGYAEWYWWTLKNPSSDGGATQRYHEKEFGANFTYQDFVSRFDCRLFDANE
..:::.:.. ::.:: .. . . .. . .. .: :.:: : ..:.::.
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::.:.. :::::.:::::::::.:::.:: :::::... :: ::: :: ...: :.
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.:::.::::::.::.: : :... : :.. : .: ..:..:.::..:.:::
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..::.:: ::.:::..: :. ::..:::::. :.::::: .:..:: .: ::::::
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:: :.:: . .:: . ::. .:: ::.::::.:...:: .::: . .::
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..:.::..:.:.:: . :: :: .: ..:::.. . :::. .. : .: :.:. :
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. . ::. ::: .:. .:: . :: ...:... ...: . ... ::.:
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::...: .:.:.: . . : : :.....::::.:::: ::::: :.:.:: :
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: .::.:: :. . : ... . .:.. . :: ::.. : :: ... :.
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.. . . : :.:::::::.:.: :. ::::::.. :: :::::: . :. .:
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.::: : ::::.:..: : :: :: : ... . :. :::: :.::..:.::.: .
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..:::. :::.:::..: ::: :.::::::. :.:::.: .::..: :: .:::::
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:. .:.: . .:.. ..: :.: .:. :.::.::.::.:::. .: :: . :::
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::: ...:.::.:.:. :: :: : :.::.
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..::.: .::... : . . : : : :.:.: ...... ::. :::.: .: .: :
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:.: : ...: . . :.: :.....: . :.:.: ::.:
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. .. :. .: :. : . . ::: :.: .. : :. .. :.. :
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: : :.. :.:: : ...... .:. .. :.. :::.::.::: :.::: ....:
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: .:.:. .: ...:. : .. . : .: . . .: :. :.. : . .
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420
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. : . :.. . . :: ..:: : .: . . . : . :.. . :.:.
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:
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.:. .: :.:: . : . : . : .: . ... .:.
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:
SWALL: STDIRGGGAILAQHIFITDNTGNLRFSGNLGGGEESSTVGDLAIVGGGALLSTNEVNVCS
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